这个秘密仅仅是历代峨眉派掌门才有资格知晓的，是峨眉派创始人郭襄传给风陵师太，风陵师太再传给灭绝，最后灭绝又传给周芷若。郭靖镇守襄阳半生却仍然无力改变结局，最终襄阳城还是被蒙古铁骑踏破。在城破之前，黄蓉准备了后手，她把杨过赠送的玄铁重剑重新铸成了一刀一剑，并且把九阴真经和武穆遗书藏在其中，这就是倚天剑和屠龙刀的秘密。
倚天剑给了郭襄，屠龙刀给了郭破虏。郭靖是抱着必死的决心要与襄阳城共存，黄蓉自然是义无反顾的站在靖哥哥的身边。黄蓉打算要保全郭襄和郭破虏这一双儿女，并且把刀剑中的秘密流传与后世。武穆遗书是一部兵法奇著，如果运用的当，必然会起到举足轻重的作用，九阴真经是江湖人梦寐以求的绝世神功秘籍。郭靖和黄蓉抵抗外敌的结局是失败，黄蓉希望后人能够继续完成大业，所以才有了倚天剑和屠龙刀。
不幸的是郭破虏在战乱中丢失了性命，屠龙刀也下落不明，不幸中的大幸是郭襄带着倚天剑活了下来。但倚天时代知晓这个秘密的只有郭襄这一脉，也就是峨眉。要得到倚天剑和屠龙刀里面的秘籍和兵书，需要同时拥有这两把武器，用刀剑互砍造成损坏才可以。而屠龙刀的流落让这件事难上加难了，到郭襄临终的时候都没有完成，于是郭襄带着遗憾把秘密传给了弟子，也就是第二代峨眉掌门风陵师太。
风陵师太在世也没能完成这件事，于是秘密又传到了灭绝这一代，终于有了屠龙刀的下落，被谢逊抢走，远走冰火岛躲避数十年。灭绝的峨眉派和谢逊的明教本就是敌对，她武功又不如谢逊，还不知道谢逊的下落，所以也没能完成郭襄的夙愿。最后周芷若靠着与张无忌的关系，在冰火岛上用计骗走了屠龙刀，加上峨眉派的倚天剑，才得到了刀剑之中的秘密。
《倚天屠龙记》中郭靖、黄蓉夫妇铸造倚天剑，屠龙刀的目的是什么？
《倚天屠龙记》中郭靖、黄蓉夫妇铸造倚天剑、屠龙刀的目的，是期望有人凭借刀剑中的《武穆遗书》兵法，以及《九阴真经》和《降龙十八掌》武功功法，摧毁蒙古统治，光复大汉河山。替天行道，为民除害。一、郭靖、黄蓉铸造倚天剑、屠龙刀始末。1、郭靖、黄蓉铸造倚天剑、屠龙刀涉及的《九阴真经》。《九阴真经》是金庸小说《射雕英雄传》里，中原五大绝顶高手华山论剑争夺的至高武功秘籍。
华山论剑中，中神通王重阳夺得了《九阴真经》，因而获得武功第一高手称号。王重阳死后，把《九阴真经》交给了师弟周伯通。周伯通在桃花岛上把《九阴真经》传授给了郭靖。2、郭靖、黄蓉铸造倚天剑、屠龙刀涉及的《降龙十八掌》。金庸小说《射雕英雄传》里，丐帮帮主洪七公精擅《降龙十八掌》，洪七公凭借《降龙十八掌》，在华山论剑中夺得中原武林五绝之一“北丐”的称号。
洪七公后来把《降龙十八掌》教给了郭靖。3、郭靖、黄蓉铸造倚天剑、屠龙刀涉及的《武穆遗书》。金庸小说《倚天屠龙记》里说，南宋民族英雄岳飞，当年抵抗金国入侵，百战百胜。岳飞死后，谥号武穆，写了一部兵书名为《武穆遗书》，藏在南宋朝廷临安附近。被金国王子完颜洪烈得知。完颜洪烈为了借助《武穆遗书》打败蒙古和大宋，收罗了一批江湖奇才异能之士，抢夺《武穆遗书》，不料《武穆遗书》已被铁掌帮先行盗走，藏在铁掌峰上。
后来被郭靖、黄蓉得到。到了小说《神雕侠侣》和《倚天屠龙记》里，郭靖镇守襄阳，凭借《武穆遗书》多次大败蒙古军队。最后由于南宋朝廷腐败，权奸当道，南宋王朝的覆灭已成必然。郭靖、黄蓉夫妇请高手匠人，把神雕大侠杨过送给郭襄的玄铁重剑加上西方精金，铸造成屠龙刀和倚天剑，把《武穆遗书》和《九阴真经》、《降龙十八掌精义》放置于刀剑之中。
二、郭靖、黄蓉夫妇铸造倚天剑、屠龙刀的目的。郭靖、黄蓉夫妇铸造倚天剑、屠龙刀是期望有人凭借屠龙刀里的《武穆遗书》屠了蒙古皇帝这个“龙”，赶走蒙古侵略者，光复大汉河山。期盼有人手持倚天剑替天行道，为民做主。手持倚天剑制衡新的暴君，保天下民生。郭靖、黄蓉铸造倚天剑、屠龙刀后，屠龙刀交给了儿子郭破虏，倚天剑交给了女儿郭襄。
随后郭黄二人双双为国捐躯。郭破虏不知所终，郭襄以及峨嵋派第二代、第三代掌门人，都没有寻找到屠龙刀。郭靖、黄蓉夫妇铸造屠龙刀、倚天剑的本意江湖中人并不知道。后来江湖上流传的，“号令天下，莫敢不从”，是把屠龙刀当作武林至尊的标志了，这是曲解了郭靖、黄蓉夫妇的原意。江湖中人为争夺屠龙刀死伤枕藉，掀起了江湖上的血雨腥风，更是郭靖、黄蓉始料未及的。
三、《倚天屠龙记》中，郭靖、黄蓉夫妇铸造倚天剑、屠龙刀的作用。按照小说《倚天屠龙记》的交代，屠龙刀中的武穆遗书最初为峨嵋派第四代掌门人周芷若所得，后来交给了明教教主张无忌，张无忌把它交给了徐达。张无忌嘱咐徐达要以武穆遗书中记载的岳飞的用兵韬略，击败蒙古军队，赶走侵略者。为民做主。假如有人以此奇书夺得了江山，却鱼肉百姓，骑在人民头上作威作福，自然有人手持倚天剑取他项上人头。
黄蓉是如何将《武穆遗书》和《九阴真经》藏于倚天剑和屠龙刀中而不会毁坏它们？
我是萨沙，我来回答。这也是书的一个漏洞。写的时候金庸想当然，认为刀剑里面只能放下绢帛之内的东西，不然写不了这么多的字。于是，金庸就说周芷若拿出来的只写满秘籍的绢帛。但是，但忘了之前说郭靖黄蓉是将杨过赠送的玄铁剑熔了，然后才铸造成倚天剑屠龙刀。融化自然需要高温，绢帛肯定直接就烧掉了。还有，夺取屠龙刀的人，曾经对屠龙刀进行融化，只是没有成功而已。
俞岱岩就曾经看过三个老头，试图将屠龙刀熔掉。《倚天屠龙记》里，屠龙刀在炉中“火焰由红转青，由青转白”，屠龙刀“却始终黑黝黝地，竟没起半点暗红之色”，可见其熔点之高。不过，屠龙刀没有被熔掉，不代表它不会传导热量。作为金属的刀，热量一定会传到刀剑内部，将绢帛烧毁。后来吴劲草重新修复屠龙刀的时候，夹着刀的火钳熔化了，刀还没事。
铁的熔点是1538度，而绢帛熔点200多度，如果火钳熔化了，绢帛早就烧成灰了。这是金庸无法自圆其说的地方。所以，新修版就修正了这一点，说成在倚天剑和屠龙刀里面发现两个铁片，拼凑在一起是一个原来桃花岛的地图，注明了埋藏密集的具体位置。周芷若根据这个地图，上了桃花岛，最终找到了埋藏的秘籍，由此练成了九阴真经速成的武功，还得到了武穆遗书。
