全体股东决定将公司承包给其中一个股东经营，该承包费如何定性，要不要入帐交税？
企业承包经营一般有2种情况，第一种是承包者实行独立核算、自负盈亏，承包者需向发包方（主体企业）定额上交承包费的，从税收角度属于主体企业在约定的时间内将场地、房屋、物品、设备或设施等使用权转让给他人经营而取得劳务收入的纳税范围，属于经营租赁的应税行为，应按“服务业”中的“租赁业“税目缴纳增值税，此时发包方（企业）按收取的承包费作为经营收入，承包方按上交的承包费作为经营成本。
第二种是公司实行内部指标考核、承包者不自负盈亏，仍由企业统一核算盈亏，这时由于企业的经营权没有改变，其收回的承包费不属于增值税的纳税范围，不需缴纳增值税。根据你说的情况，公司股东决定将公司承包给其中一个股东，由其自负盈亏，并每年上交承包费40万元。这样，第一个问题的答案就是，每年40万元的承包费属于公司的收入（利润来源），同时也是承包人的经营成本。
第二个问题，承包费必须由公司入账核算。根据权责发生制原则，即使公司暂时没有收到款项，也应按照合同约定的时间、金额及时足额确认收入并申报缴纳增值税。如果承包人将承包费直接付给其他股东，视同公司向股东分配利润，公司需缴纳企业所得税，股东需缴纳个人所得税。第三个问题，对公司来说，需就其得到的承包费按照租赁业务申报缴纳增值税及附加税费，如果有利润时还需要缴纳企业所得税。
租赁标的为房屋、土地等不动产的，税率为9%，如果为2016年4月30日前取得的不动产，可以选择适用简易计税方法,按照5%征收率计算应纳税额。需要特别说明的是，由于公司实行内部承包经营，其法律主体地位未发生变化，公司需承担承包人经营业务可能未足额及时申报缴纳及接受虚开发票，对外虚开发票等相关责任和义务。
建议公司在实施承包经营时，一要做好清产核资，把公司现有的各项资产、负债项目核查清楚并编制成册；二是做好责任划断，包括公司遗留债权的清收，遗留债务的偿还，遗留产品质量保证，遗留客户保证金的退付，遗留税款和职工工资薪酬的支付及其他，明确责任主体和结算方法；三是资产移交，移交承包人继续销售的存货，移交承包人使用的固定资产等，要编制移交清单，确定交接责任；四是对公司银行账户的后续使用和管理作出约定；五是对公司的证照、资质、市场等管理作出约定；六是对员工的继续使用及工资薪酬的约定等。
